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Studienbrief-Einblicke

Zu einigen Kursen gibt es Kurs-Demos in der Kursumgebung des Lernraums virtuelle Universität, auf die Sie auch ohne Belegung des Kurses zugreifen können. Dabei handelt es sich um Auszüge aus den aktuellen Studienbriefen. Neben den Kursbeschreibungen im Lernraum virtuelle Universität und im Modulhandbuch eine gute Informationsquelle, da Sie in die Kurse "hineinschnuppern".

Nachfolgend stellen wir Ihnen in etwa 12-wöchigem Rhythmus ein Modul dieses Studiengangs vor. Alle Kurse, zu denen es Schnuppermaterial gibt finden Sie in der Übersicht. Das Material finden Sie unter Kursmaterial / Kurs-Demo. Beachten Sie, dass nicht alle Kurse in einem Semester angeboten werden und dass das Demo-Material oft erst zu Beginn des Semesters eingestellt wird. Insbesondere zur Einschreibung steht nicht immer das Demo-Material bereit.

[04.05.2012] Modul "Grundlegende Algorithmen der Bio-Informatik", Kurs 01738

Das Modul "Grundlegende Algorithmen der Bio-Informatik" beinhaltet den Kurs 01738 "Grundlegende Algorithmen der Bio-Informatik". Es ist ein Stammodul aus dem Bereich M1 Grundlagen der Informatik und kann im Studiengang Master of Science im Fach Informatik mit einem Leistungsnachweis oder einer mdl. Modulprüfung abgeschlossen werden. Da es keine Pflichtmodule im Studiengang gibt, ist das ein Modul, das Sie wählen können - aber nicht müssen. Im Studiengang Master of Science in Informatik muss mindestens ein Modul aus Bereich M1 gewählt werden und mindestens eine Modulprüfung über ein Modul aus dem Bereich M1 abgelegt werden. Mit einer mdl. Modulprüfung im Modul "Grundlegende Algorithmen der Bio-Informatik" können Sie die Bedingungen erfüllen. Achtung: mündliche Prüfungen bei Prüfer Dr. Merkl finden in Regensburg statt.

Der Kurs 01738 wird im Wintersemester eingesetzt und einmal im Studienjahr angeboten. Den Basistext (s.u.) müssen sich die Kursbelegerinnen und Kursbeleger selbst rechtzeitig besorgen. Einige Online-Buchhändler gewähren einen Einblick in das Buch. Vom Begleittext sind die ersten Seiten frei zugänglich.

Im Sommersemester wird ein Seminar zur Bioinformatik (Kurs Nr. 01939) angeboten.

Inhalt:
Zeitgemäße Biologie und Biochemie sind ohne den Einsatz informatischer Methoden undenkbar geworden. Die Bioinformatik ist der Teil der Computerwissenschaft, der Datenbanken, Algorithmen und Werkzeuge für diese Anwendungen konzipiert und umsetzt. Aufgrund der speziellen Anforderungen, die sich aus der Natur der biologischen Objekte ergeben, hat die Bioinformatik spezielle Verfahren entwickelt, die in keinem anderen Teilgebiet der Informatik ähnliche Bedeutung haben und gesondert bearbeitet werden müssen. Dieser Kurs bietet eine Einführung in die wichtigsten Modelle und Algorithmen der Bioinformatik. Schwerpunkte setzen Methoden des Sequenzvergleichs (dynamisches Programmieren) und Verfahren zur Charakterisierung von Proteinfamilien (Hidden-Markov-Modelle). Daneben werden Algorithmen zur Vorhersage der Proteinraum-, Proteinsekundär- und RNA-Sekundärstruktur vorgestellt und es wird das Berechnen von Stammbäumen erläutert. Eingegangen wird auch auf die Analyse von Datensätzen aus Genomics-, Transkriptomics- und Proteomics-Experimenten sowie auf die wichtigsten bioinformatischen Datenbanken. Der Kurs ist in sich geschlossen; er vermittelt die für das Verständnis erforderlichen statistischen und biologischen Grundlagen und bietet eine Einführung in genetische Algorithmen und neuronale Netze. Basistext ist das Buch R. Merkl, S. Waack "Bioinformatik Interaktiv" 2. Auflage 2009 aus dem Verlag WILEY-VCH.
Qualifikationsziele:
Studierende sollen die vorgestellten Werkzeuge benutzen können, um Standardfragen zu beantworten; Studierende sollten einschätzen können, mit welchen Algorithmen und Techniken Problemstellungen anzugehen sind.

Aktualisiert: UBec | 04.05.2012

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